Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms