Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vps8Q0P5W1 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms