Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Spata18Q0P557 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms