Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms