Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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