Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms