Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
H3f3aP84244 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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