Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
TgfbiP82198 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TgfbiP82198 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms