Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Src-205ENSMUST00000109533 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Mid1-204ENSMUST00000112104 3860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx2P81066 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms