Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Otx2P80206 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Otx2P80206 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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