Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab1AP62821 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms