Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Snrpd1P62315 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Snrpd1P62315 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snrpd1P62315 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snrpd1P62315 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snrpd1P62315 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snrpd1P62315 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Snrpd1P62315 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snrpd1P62315 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms