Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Vbp1P61759 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Vbp1P61759 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vbp1P61759 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Vbp1P61759 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Vbp1P61759 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vbp1P61759 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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