Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Taf13P61216 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Taf13P61216 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Olfr77-202ENSMUST00000217347 5980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Taf13P61216 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms