Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
P58686 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
P58686 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
P58686 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms