Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Strn4P58404 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Strn4P58404 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Strn4P58404 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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