Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Lim2P56563 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms