Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ovgp1-201ENSMUST00000000573 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Sh3bp1P55194 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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