Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Fgd1P52734 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms