Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
SftpbP50405 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms