Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms