Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Epb41P48193 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Epb41P48193 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms