Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms