Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ThpoP40226 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms