Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Upk2P38575 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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