Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprkP35822 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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