Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Apoc1P34928 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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