Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Apoc3P33622 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms