Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxc11P31313 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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