Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxrbP28704 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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