Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap1P28660 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms