Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Psmb9P28076 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Psmb9P28076 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms