Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pde6aP27664 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pde6aP27664 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6aP27664 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6aP27664 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6aP27664 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Pde6aP27664 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pde6aP27664 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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