Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gja1P23242 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms