Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb9P20615 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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