Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Ntf3P20181 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ntf3P20181 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms