Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RhoP15409 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RhoP15409 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RhoP15409 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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