Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms