Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cenpx-204ENSMUST00000106155 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
DmdP11531 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC192333.3-201ENSMUST00000224041 463 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
DmdP11531 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms