Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cfdp1O88271 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms