Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Sp100O35892 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sp100O35892 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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