Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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