Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Myo1h-201ENSMUST00000124316 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ces5a-201ENSMUST00000077816 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Chat-201ENSMUST00000070125 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ptgr1-201ENSMUST00000030069 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm43366-201ENSMUST00000199829 2655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrkcshO08795 Il6st-209ENSMUST00000184445 1870 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrkcshO08795 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms