Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Gm3278L7N2D2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3278L7N2D2 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3278L7N2D2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3278L7N2D2 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Gm3278L7N2D2 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm3278L7N2D2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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