Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm20939L7N243 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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