Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ablim1-205ENSMUST00000111526 2164 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Trp63-206ENSMUST00000115307 1782 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Rab27a-203ENSMUST00000184146 3168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Gm21887J3QQ04 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Car1-203ENSMUST00000181860 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm42109-202ENSMUST00000200893 664 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm21887J3QQ04 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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