Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Smim18J3QNP2 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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