Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tmem200cJ3QK46 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms