Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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