Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pot1bH7BX60 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms